2016年4月20日22時，按照《飛虹大橋度汛方案及防洪應急預案》，根據飛虹大橋水位情況，飛虹大橋防汛辦協同施工單位省二建公司、監理單位贛建公司啟動四級應急響應，進行全天候值守，并做好防汛準備工作。

4月21日8時，橋址水位24.6米，啟動三級應急響應，將吊車、打樁機等相關物資轉至安全區域，安排2臺挖機清理棧橋處上游沖下的樹木及垃圾，準備防汛人員及挖機、吊車等設備進行搶險，并向市防指匯報相關防汛情況。

9時，市高新區管委會主任張良華、黨工委副書記、常務副主任徐輝、副主任程立芳等現場視察水情，并召開現場會議進行部署，要求嚴格按照防汛預案做好相關工作，確保人員安全。

10時30分，水位24.8m,因水流過急，為保證人員安全，棧橋上參與防洪搶險的其它人員全部撤離，為防止漂浮物累積對鋼棧橋產生的沖擊，只留2臺挖機及指揮人員清理棧橋處的樹木等漂浮物，并使用專用設備不間斷監測橋體受沖擊形變情況。

14時10分，水位達25.6m，水流湍急，大量漂浮的樹干、雜物、垃圾等漂浮物沖擊棧橋，導致主棧橋沖毀約70m、失穩約80m，支棧橋沖毀36m。沖毀時間僅十幾秒，因處置妥當，未出現人員傷亡。飛虹大橋防汛辦立即向市防洪指及相關領導進行匯報。

　　14時40分，市高新區黨工委書記戴啟文、黨工委副書記、常務副主任徐輝、黨工委副書記邱小劍現場視察，要求將人員安全放在一位，做好人員執守工作，隨時觀察水情、汛情，將相關損失降到低，并委托徐輝立即召開高新區防洪度訊工作專題會。

16時，市高新區黨工委副書記、常務副主任徐輝主持召開高新區防洪度汛專題會。

17時，市高新區管委會主任張良華現場視察。

18時，洪峰抵達橋址，水位約26.2米。

18時20分，市高新區黨工委書記戴啟文現場視察。

20時20分，市高新區黨工委副書記、常務副主任徐輝現場視察。

目前，已停止一切水上作業，待洪峰過后，對落入水中物資采用駁船打撈。